Waiheke-eiland ligt in de Golf van Hauraki, op ongeveer 35 minuten varen afstand van Auckland in Nieuw-Zeeland. Het eiland is 19,3 km lang en heeft een totale oppervlakte van 92 km².
Het heeft een kustlijn van 133 km, waarvan 40 km strand. Het is de op-een-na-grootste van de eilanden in de Golf van Hauraki (na Great Barrier eiland) en is het dichtstbevolkte en best bereikbare eiland. De haven van Matiatia aan de westkust ligt 17,7 km van Auckland en de oostkust is 21,4 km van Coromandel.
Het eiland is erg heuvelachtig met een aantal plateaus, het hoogste punt is Maunganui (231 meter). Het klimaat is over het algemeen warmer dan in Auckland, met minder regen en meer aantal uren zonneschijn.